Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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