Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cxxc1Q9CWW7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms