Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms