Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms