Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pard3bQ9CSB4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pard3bQ9CSB4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms