Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Msmo1Q9CRA4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Msmo1Q9CRA4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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