Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PsenenQ9CQR7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms