Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms