Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GpnmbQ99P91 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms