Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pbx4Q99NE9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pbx4Q99NE9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pbx4Q99NE9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pbx4Q99NE9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pbx4Q99NE9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pbx4Q99NE9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pbx4Q99NE9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pbx4Q99NE9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms