Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Mrpl27Q99N92 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mrpl27Q99N92 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms