Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms