Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms