Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms