Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pagr1aQ99L02 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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