Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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