Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Krcc1Q99JT5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Krcc1Q99JT5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Krcc1Q99JT5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Krcc1Q99JT5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Krcc1Q99JT5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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