Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Smim11aQ99J19 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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