Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Slc8b1Q925Q3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms