Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms