Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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