Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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