Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vrk3Q8K3G5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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