Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sash3Q8K352 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sash3Q8K352 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms