Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ssh3Q8K330 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssh3Q8K330 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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