Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbm48Q8K2X2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbm48Q8K2X2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms