Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim68Q8K243 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms