Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Habp2Q8K0D2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Habp2Q8K0D2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms