Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrit1Q8K099 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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