Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm17Q8JZX4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rbm17Q8JZX4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm17Q8JZX4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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