Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Znf628Q8CJ78 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Znf628Q8CJ78 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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