Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms