Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Hpf1Q8CFE2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Hpf1Q8CFE2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Hpf1Q8CFE2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms