Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nhlrc3Q8CCH2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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