Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ephb1Q8CBF3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ephb1Q8CBF3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms