Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc159Q8C963 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms