Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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