Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trim35Q8C006 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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