Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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