Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp38Q8BW70 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp38Q8BW70 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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