Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.6 ms