Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssc5dQ8BV57 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms