Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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