Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms