Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcsk9Q80W65 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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