Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NischQ80TM9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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