Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1cQ7TSF0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms