Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LnpkQ7TQ95 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LnpkQ7TQ95 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms