Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smap2Q7TN29 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms