Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Eci3Q78JN3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Eci3Q78JN3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Eci3Q78JN3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Eci3Q78JN3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms